区分DNA中5-甲基化胞嘧啶和5-羟甲基化胞嘧啶的方法
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区分DNA中5-甲基化胞嘧啶和5-羟甲基化胞嘧啶的方法
来源:北方有色网
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简介: 本发明属于表观遗传学技术领域,具体涉及一种区分DNA中5‑甲基化胞嘧啶和5‑羟甲基化胞嘧啶的方法。该方法基于APOBEC3A对5‑mC和5‑hmC脱氨基转化的差异性,直接将被检测位点作为特异性引物的3’末端,qPCR扩增后不同的甲基化修饰会产生不同的扩增Ct值,根据酶转化产物和阴性对照之间的Ct值差异,从而快速区分被检测位点的修饰是甲基化修饰还是羟甲基化修饰,提高了分析时效性,节约了二次测序成本。该方法转化过程对DNA几乎无损伤作用,可利用低至1ng的样本DNA完成分析,能够广泛应用于DNA表观遗传分析领域。
本发明属于表观遗传学技术领域,具体涉及一种区分DNA中5‑甲基化胞嘧啶和5‑羟甲基化胞嘧啶的方法。该方法基于APOBEC3A对5‑mC和5‑hmC脱氨基转化的差异性,直接将被检测位点作为特异性引物的3’末端,qPCR扩增后不同的甲基化修饰会产生不同的扩增Ct值,根据酶转化产物和阴性对照之间的Ct值差异,从而快速区分被检测位点的修饰是甲基化修饰还是羟甲基化修饰,提高了分析时效性,节约了二次测序成本。该方法转化过程对DNA几乎无损伤作用,可利用低至1ng的样本DNA完成分析,能够广泛应用于DNA表观遗传分析领域。
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