深度测序基因序列数据文件的无损压缩方法
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深度测序基因序列数据文件的无损压缩方法
来源:北方有色网
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简介: 本发明公开深度测序基因序列数据文件的无损压缩方法,以传输过程中不需要传输的内置标准参考基因组和内置字典文件作为对比。因此如果传输或者存储过程中丢失转换后的基因序列或者本专利压缩后的基因序列数据的话,只要其他人员无法取得内置标准基因和内置字典文件,就无法还原相关的序列,大大加强了安全性。未匹配上的变异,增设临时字典,该字典随着文件压缩和传输。如果第一次未匹配到的特殊变异写入该字典后,后面几百甚至上万次测序数据中出现的该特殊变异就不用另外存储,大大节省了空间。本发明有效的降低了DNA测序序列的数据容量,因此无论存储还是传输过程中容量大大减小了。
本发明公开深度测序基因序列数据文件的无损压缩方法,以传输过程中不需要传输的内置标准参考基因组和内置字典文件作为对比。因此如果传输或者存储过程中丢失转换后的基因序列或者本专利压缩后的基因序列数据的话,只要其他人员无法取得内置标准基因和内置字典文件,就无法还原相关的序列,大大加强了安全性。未匹配上的变异,增设临时字典,该字典随着文件压缩和传输。如果第一次未匹配到的特殊变异写入该字典后,后面几百甚至上万次测序数据中出现的该特殊变异就不用另外存储,大大节省了空间。本发明有效的降低了DNA测序序列的数据容量,因此无论存储还是传输过程中容量大大减小了。
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标签:无损检测
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