简介： 本申请公开了一种燃料电池系统、燃料电池发动机及新能源汽车，应用于燃料电池技术领域，用以解决燃料电池系统在冷启动时能量损耗较大、冷启动时间较长的问题。具体包括并联组态的第一电堆和第二电堆，以及设置在第一电堆的冷却液入口和第二电堆的冷却液入口之间的冷却液管路上的第一阀门。这样，在整车请求功率不超过功率阈值时第一阀门关闭，冷却液流入第一电堆，第一电堆单独工作，在整车请求功率超过功率阈值时第一阀门导通，冷却液同时流入第一电堆和第二电堆，第一电堆和第二电堆同时工作，从而可以实现第一电堆和第二电堆的异步启动，缩短冷启动时间，而且，通过利用第一电堆自热而升温的冷却液为第二电堆加热，可以降低冷启动的能量损耗。