简介： 本发明涉及一种基于计算机分子对接技术的何首乌中肝毒性化合物的筛选方法，其包括以下步骤：(1)获得何首乌中至少一种待检化合物的三维化学结构；(2)构建OATP1B1、OATP1B3的蛋白同源模建结构，并分别确定OATP1B1和OATP1B3的活性位点；(3)将所述待检化合物和作为OATP1B1和OATP1B3共同底物的阳性化合物分别与所述活性位点进行计算机分子对接，获得对接打分；(4)所述待检化合物判定为肝毒性化合物的条件是：所述待检化合物的对接打分达到对接判定值。本发明的筛选方法快速、经济，操作简单，而且可实现众多化合物的高通量筛选。