分离和富集以及从头组装MHC基因的方法
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分离和富集以及从头组装MHC基因的方法
来源:北方有色网
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简介: 本发明属于生物化学与分子生物学技术领域,具体为一种分离和富集以及从头组装人类主要组织相容性复合体基因的方法。本发明方法是基于CRISPR/cas9和脉冲场凝胶电泳(PFGE)系统,对MHC区域大片段DNA进行分离,对目标区域进行有效富集,利用10X Genomics平台进行长片段DNA测序,通过基因的从头组装获得N50 scaffold >0.9 Mb的MHC单体型,并且覆盖度达到整个4.6M MHC区域的90%以上;相较于传统二代测序组装技术,本发明方法具有明显的优越性。
本发明属于生物化学与分子生物学技术领域,具体为一种分离和富集以及从头组装人类主要组织相容性复合体基因的方法。本发明方法是基于CRISPR/cas9和脉冲场凝胶电泳(PFGE)系统,对MHC区域大片段DNA进行分离,对目标区域进行有效富集,利用10X Genomics平台进行长片段DNA测序,通过基因的从头组装获得N50 scaffold >0.9 Mb的MHC单体型,并且覆盖度达到整个4.6M MHC区域的90%以上;相较于传统二代测序组装技术,本发明方法具有明显的优越性。
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标签:化学分析
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