简介： 本发明提供一种全转录组范围同时获取RNA丰度及活性RNA聚合酶位点的方法及试剂盒。该方法基于活性RNA聚合酶可在体外将未修饰的三磷酸核苷、N⁶‑烯丙基三磷酸腺苷(a⁶ATP)、N⁴‑烯丙基三磷酸胞苷(a⁴CTP)转录进新生RNA中，经化学处理诱导使修饰碱基在逆转录成DNA过程中发生碱基突变，然后通过核酸测序手段识别突变位点，进而得到N⁶‑烯丙基腺嘌呤(a⁶A)和N⁴‑烯丙基胞嘧啶(a⁴C)位点，该位点即为活性RNA聚合酶原本所在的位点。未突变的部分即为原有的RNA，即可得到新生RNA的丰度。本发明首次实现了在隔离的染色质中进行a⁶A、a⁴C的特异性标记，能够借助突变测序的手段进行定位，并利用一次测序获取活性聚合酶位点与RNA丰度两种信息。