简介： 本发明公开了一种确定smiles表达式之间是否具有子结构关系的方法，包括：定义并存储常见原子、化学键和支链关系；定义切片最小粒度：相邻原子与之间的化学键关系与主支链关系作为最小粒度单位；定义起始原子和终止原子，其中起始原子为所述最小粒度对应的第一个原子，终止原子为所述最小粒度对应的第二个原子；基于常见原子、化学键和支链关系对获取的smiles表达式进行分析以将smiles表达式切割成一个个原子对，统计smiles表达式包含的环的个数及原子对的种类、种类个数并存储到哈希表中；根据原子对的种类、种类个数、环的个数确定smiles表达式之间是否具有子结构关系。本发明方法可用于化学式部分结构检索，方法简单，执行效率高。