简介： 本发明提供一种利用质谱数据确定有机物结构的方法和系统，涉及化学分析技术领域。该方法，包括以下步骤：S1、获得碎片片段结构；S2、对所述碎片片段结构计算得出相应的相对分子质量和质荷比；S3、存储已知结构的有机物及其碎片片段结构的数据信息；S4、将待确定结构的有机物信息输入数据库系统；S5、给出设定权重范围内的有机物的化学信息和质谱测试对应质荷比的碎片片段结构信息。通过将数千万化学有机物质在含有质谱裂解规律的算法下将其结构碎片化处理，然后将他们集成数据库，以供查询匹配，数据量更加丰富，包含的裂解情况更多，给予的参考价值更高，缩短了质谱解析时间，提供优选的直观分析结果，可以显著提高工作效率。