简介： 本发明公开了一种基于多元信息集成和最小二乘法的药物关系预测方法，包括步骤1：获取待研究的药物集合的药物关系矩阵；步骤2：计算每个药物与其余药物的高斯核相似性；步骤3：根据药物集合中所有药物的特征信息采用余弦角相似性方法计算每个药物与其余药物的特征相似性；特征信息包括化学信息、生物信息以及表征信息；步骤4：计算每两个药物之间的高斯核相似性和特征相似性的均值得到每两个药物之间的药物相似性，并基于每两个药物之间的药物相似性构成出药物集合的药物相似性矩阵；步骤5：基于药物相似性矩阵以及药物关系矩阵采用最小二乘法进行药物对的关联关系分数计算得到药物关系预测矩阵。