简介： 本发明公开了一种基于药物子结构、分子字符描述信息的药物靶标关系预测方法，首先通过数据库获取药物子结构信息、分子字符描述信息和已知的药物靶标关系，然后根据这些药物子结构、药物分子字符描述信息和已知的药物靶标关系、单独构建药物之间的相似性矩阵，再将构建的各个相似性矩阵依照权重集成为最终的药物相似性矩阵；最后基于相似的药物靶向的靶标也相似的特点对药物的靶标关系进行预测。本发明只需要根据药物分子字符描述信息、子结构信息来构建相似性，不依赖于靶标的序列等信息，并能够对全新的药物化合物进行靶标关系预测，避免了生物化学实验所消耗的大量人力物力。实验结果表明，该方法能够较准确的预测药物靶标关系。