基于相似性和逻辑矩阵分解的miRNA‑疾病关联关系预测方法
基于相似性和逻辑矩阵分解的miRNA‑疾病关联关系预测方法
来源:北方有色网
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简介:
本发明公开了一种基于相似性和逻辑矩阵分解的miRNA‑疾病关联关系预测方法,首先计算出疾病功能相似性和miRNA功能相似性;然后利用已知miRNA疾病关联关系构建疾病高斯核相似性和miRNA高斯核相似性;集成疾病功能相似性和高斯核相似性得到最终的疾病相似性,集成miRNA功能相似性和高斯核相似性得到最终的miRNA相似性。最后基于逻辑矩阵分解模型进行预测miRNA和疾病的潜在特征向量,并根据逻辑回归函数来计算miRNA和疾病对的关联关系分数。本发明也能够对全新miRNA的疾病关系进行预测,避免了生物化学实验室所消耗的人力物力财力准确性高。
本发明公开了一种基于相似性和逻辑矩阵分解的miRNA‑疾病关联关系预测方法,首先计算出疾病功能相似性和miRNA功能相似性;然后利用已知miRNA疾病关联关系构建疾病高斯核相似性和miRNA高斯核相似性;集成疾病功能相似性和高斯核相似性得到最终的疾病相似性,集成miRNA功能相似性和高斯核相似性得到最终的miRNA相似性。最后基于逻辑矩阵分解模型进行预测miRNA和疾病的潜在特征向量,并根据逻辑回归函数来计算miRNA和疾病对的关联关系分数。本发明也能够对全新miRNA的疾病关系进行预测,避免了生物化学实验室所消耗的人力物力财力准确性高。
标签:化学分析
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