简介： 本发明公开了基于深度自编码和自适应融合的药物新用途预测方法，包括：将药物化学结构数据和药物靶蛋白数据融合、降维，得到药物特征数据；利用药物特征数据，计算药物相似度，通过药物相似度计算药物‑疾病关联预测值；利用药物副作用数据，计算药物相似度，通过药物相似度计算药物‑疾病关联预测值；使用药物‑疾病关联数据计算疾病相似度，通过疾病相似度计算药物‑疾病关联预测值；分别确定计算的药物‑疾病关联预测值的权重；融合计算的药物‑疾病关联预测值，得到融合后的药物对疾病的预测值。本发明融合分别基于药物相似度、疾病相似度计算得到的药物‑疾病关联预测值，得到融合后的药物对疾病的预测值，提高了预测结果的准确度。