简介： 一种预测小分子CYP代谢酶的代谢位点的方法及系统，包括：收集与代谢位点相关的分子结构数据，基于不同代谢酶亚型将收集的数据整理成为不同亚型的数据集；将二维分子结构转化为三维分子结构；将分子三维结构中的原子类型的矢量化；将分子三维结构中距离的矢量化；将原子类型的矢量作为图卷积神经网络中顶点信息矢量化矩阵，将距离的矢量作为图卷积神经网络中边信息矢量化矩阵，根据图卷积神经网络模型更新顶点信息，计算原子为代谢位点的概率；在不同CYP代谢酶亚型上根据为代谢位点的概率预测代谢位点；上述方法及系统，对分子与不同亚型的CYP代谢发生化学反应的代谢位点预测，该预测结果可以帮助药物化学家设计或者优化分子结构。