基于图注意机制迁移学习的小分子药物hERG毒性预测方法和装置
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基于图注意机制迁移学习的小分子药物hERG毒性预测方法和装置
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简介: 本发明揭示了一种基于图注意机制迁移学习的小分子药物hERG毒性预测方法和装置,该方法包括以下步骤:S1:数据集预处理,将待检测的类药化合物通过分子指纹生成软件生成指纹序列;S2:通过S1步骤生成的指纹序列得到原子及化学键特征,将原子及化学键特征构建分子图及图特征;S3:通过图注意力机制对S2步骤得到的分子图进行处理,生成分子中每个原子特征向量;S4:通过图注意力机制及每个原子的特征生成分子特征向量。该方法基于图注意力机制对分子图结构进行处理,有效获取对预测属性值贡献大的子结构,基于迁移学习对源域和目标域数据集进行处理,有效解决样本量不足的问题。
本发明揭示了一种基于图注意机制迁移学习的小分子药物hERG毒性预测方法和装置,该方法包括以下步骤:S1:数据集预处理,将待检测的类药化合物通过分子指纹生成软件生成指纹序列;S2:通过S1步骤生成的指纹序列得到原子及化学键特征,将原子及化学键特征构建分子图及图特征;S3:通过图注意力机制对S2步骤得到的分子图进行处理,生成分子中每个原子特征向量;S4:通过图注意力机制及每个原子的特征生成分子特征向量。该方法基于图注意力机制对分子图结构进行处理,有效获取对预测属性值贡献大的子结构,基于迁移学习对源域和目标域数据集进行处理,有效解决样本量不足的问题。
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标签:化学分析
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