简介： 本发明提出了一种基于分子指纹预测的代谢物识别系统及其应用方法，包括：数据预处理模块，所述数据预处理模块用于代谢物表征数据进行采集分析，并提取特征参数；分子指纹模块，所述分子指纹模块用于采集数据预处理模块提取的特征参数，并进行分子指纹预测，以确定代谢物的可能化学结构；候选化合物筛选模块，所述候选化合物筛选模块用于对代谢物的可能化学结构进行初步筛选；候选化合物计算模块，所述候选化合物计算模块用于将代谢物的可能化学结构与代谢物的特征参数进行匹配计算，确定代谢物的预测结果。本发明基于代谢物串联质谱数据的分子指纹预测算法建立在深度神经网络模型上，能够根据输入的串联质谱数据预测对应未知代谢物的分子指纹。