简介： 本发明公开了一种细胞内新的生物合成路径探测方法，所述方法包括：S1、制备样本切片并在所述样本切片中注入同位素溶液，生成目标样本切片；S2、对所述目标样本切片进行MS检测，得到所述样本切片的中化学物质的代谢路径，其中，S2包括如下步骤：S21、对所述目标样本切片进行MS检测，得到所述目标样本切片对应的MS数据并对所述MS数据进行分析；S22、根据所述MS数据的分析结果，得到所述样本切片的中化学物质的代谢路径；本发明能够对标记同位素的代谢物离子强度值进行标准化，避免不同样本之间可比性差，保证有效的同位素跟踪，以得到完整的化学物质的合成路径。