化学物质P-糖蛋白相互作用QSAR筛选方法
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化学物质P-糖蛋白相互作用QSAR筛选方法
来源:北方有色网
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简介: 本发明提供了一种化学物质P‑糖蛋白相互作用QSAR筛选方法,包括如下步骤:(1)采集数据;(2)将分子描述符的值进行归一化,使每个分子描述符的权重平等;(3)将得到的数据集分为训练集、预测集和外部验证集;(4)对分子描述符根据分子描述符之间的相关系数进行筛选;(5)将MPSO与GA进行嵌套循环,并优化支持向量机的内核参数与最优特征自变量子集后即成。本发明所述的化学物质P‑糖蛋白相互作用QSAR筛选方法将MPSO与GA进行嵌套循环,并确定SVM的最优特征自变量子集和优化内核参数,在此基础上构建定量构效关系模型,对P‑gp底物类和抑制剂类化合物具有较为准确的分类。
本发明提供了一种化学物质P‑糖蛋白相互作用QSAR筛选方法,包括如下步骤:(1)采集数据;(2)将分子描述符的值进行归一化,使每个分子描述符的权重平等;(3)将得到的数据集分为训练集、预测集和外部验证集;(4)对分子描述符根据分子描述符之间的相关系数进行筛选;(5)将MPSO与GA进行嵌套循环,并优化支持向量机的内核参数与最优特征自变量子集后即成。本发明所述的化学物质P‑糖蛋白相互作用QSAR筛选方法将MPSO与GA进行嵌套循环,并确定SVM的最优特征自变量子集和优化内核参数,在此基础上构建定量构效关系模型,对P‑gp底物类和抑制剂类化合物具有较为准确的分类。
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标签:化学分析
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