简介： 本发明涉及用于基于分离和分析蛋白质的羧基端肽而鉴定一个或多个样品中蛋白质的方法。分离的肽得到纯化并通过质谱法分析。母蛋白的鉴定以所述羧基端肽的质量结合额外的物理化学参数为基础。本发明还涉及计算机切割蛋白质的羧基端肽的注释数据库,所述的注释数据库包含羧基端肽的质量及其一种或多种物理化学性质。