简介： 本发明公开了一种高通量单细胞基因组5‑羟甲基嘧啶单分子可视化分析方法，属于分析化学技术领域，利用微流控芯片技术获得包裹单细胞基因组的琼脂糖凝胶微球；对其中的单细胞进行裂解处理后，每个琼脂糖凝胶微球中均包裹单细胞基因组。随后通过特异性的化学反应对单细胞基因组5‑hmC和5‑hmU标记上引物，然后滚环扩增后并杂交荧光探针，实现修饰碱基5‑hmC和5‑hmU的单分子可视化分析。本发明通过微流控液滴法可以在短时间内形成大量液滴，高效地得到包裹单细胞基因组的高通量琼脂糖凝胶微球，进而实现高通量单细胞目标物的分析，避免细胞异质性带来的差异，实现准确检测，反应具有特异性，高产率、反应条件简单、反应速度快等优势。