简介： 本发明涉及生物技术领域，特别涉及间作玉米下花生叶片基因差异表达的比较转录组分析方法，本发明利用RNA‑seq技术对花生单作与间作玉米胁迫下荚果膨大期花生功能叶的差异表达基因进行了比较分析；以代谢通路相关的差异基因为主，挖掘出了间作玉米胁迫下花生荚果产量形成的重要基因和关键代谢通路，为利用定向化学调控技术以减少间作玉米胁迫对花生产量造成的不利影响提供理论依据；并通过qRT‑PCR检测对候选差异表达基因的相对表达水平进行验证，最终表明qRT‑PCR检测结果与转录组测序分析中的倍数变化大体一致，采用转录组测序分析的方法准确、可行、有效、简单。